深圳市海洋局于1998年成立了深圳市海洋与渔业环境监测站，专门负责海洋环境与渔业环境的监测任务。监测内容包括水文气象（水温、气温、风速、风向、水深、水色、透明度、海况、简易天气现象），海水质量（pH值、盐度、溶解氧、化学耗氧量、活性磷酸盐、亚硝酸盐-氮、硝酸盐-氮、氨-氮、总汞、铜、铅、六六六、油类含量、浊度），海洋沉积物质量（总汞、铜、铅、六六六、DDT、油类含量、有机质、硫化物、粒度）和生物体污染含量（总汞、铜、铅、六六六、DDT）。各项监测均按《海洋检测规范》所规定的方法进行。获取的资料经处理统计和分析后，向外公布。
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