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产出“实用”的科研成果
作者：王小广主编 杨柳著 来源：源头与活水 ：新型科研机构 责任编辑：深小安 2023-04-07 人已围观
“过去医生看一个医学影像的片子至少需要半小时，现在通过大数据看片子只要 30 秒。”深圳市大数据研究院李镇博士介绍，“进行深度学习 模型设计与训练，可以直接输出诊断报告与病兆诊断，辅助医生诊治，明显提高了诊断效率，减少误诊率。”
大数据研究院有这样一支队伍，专门从事医疗大数据研究。医疗大数 据实验室主任万翔博士介绍，当下医疗大数据产业正处于快速发展阶段， 团队的研究目前从三个方向有序开展：一是针对电子病例进行文本数据智 能分析，二是医学影像大数据研究，三是基因组学大数据分析。除此之 外，大数据研究院还与医院合作开发了患者数据采集管理系统。对患者智 能回访及数据采集运用了先进的物联网技术，实现大规模、全方位的患者 和医务数据采集，再通过大数据处理技术协助医生为患者提供更为精准的 诊断和治疗。比如，系统可以通过病例分析，预测患者肾结石的复发概率 及可能复发的时间；也可以基于膀胱癌患者的单细胞 RNA-Seq 数据，对 膀胱癌的亚类型进行鉴别；还可以对关键致病基因进行发掘研究。研究 院与罗湖医院就肾结石疾病复发进行的大数据统计分析预测，准确率超过 90%；与罗湖区人民医院聚焦手足口病预防措施的有效性研究，也着实为市民提供了卓有成效的医疗服务。
电子病历是医院信息化建设工作的核心，医疗文书往往以自然语言的 方式进行录入，而结构化则是站在医学信息学的角度按照医学术语的要求 进行分析，将这些语义结构转化为关系型结构，并保存到数据库。
目前，医疗文本标注领域尚无成熟的系统，主要有以下几个方面的原 因：一是中英文语法不同，英文系统无法应用于中文文本；二是汉语语法 表述个人性较强；三是需要大量已标签的文本数据，目前尚未有公开的此 类数据集。因此有待建立一套完整、可实用的标注准则。大数据研究院的 科研人员针对汉语语言的特点，对现有的中文医疗文本标注方法做出改 进，建立一套完整可行的词库，同时改进和提出新的机器学习算法，开发 出中文电子病历自由文本自动标注系统，对医疗文本中的各类实体及断言 ( 包括否定 ) 进行自动标注。
大数据研究院的电子病历项目计划引入中文分词技术，可以解决电子 病历数据的结构拆分难题，实现电子病历用户在实际应用中通过自然语言 进行自由文本方式输入的同时，能够通过计算机的辅助进行病历内容的数 据化，为日后的查询、统计、数据交换提供基础。还可以实现电子病历查 询的快速索引、辅助结构化输入等实用功能。
另外一个亮点工作，就是从电子病历中提取知识图谱。医学知识图谱是实现智慧医疗的基石，有望带来更高效、精准的医疗服务。然而，现有 知识图谱构建技术在医学领域中普遍存在效率低、限制多、拓展性差等问 题。团队针对医疗数据跨语种、专业性强、结构复杂等特点，对构建医学知识图谱的关键技术进行了全面解析。
万翔博士解释道：“现阶段，国内医疗领域中基于知识图谱的疾病预 测研究工作才刚起步，所以构建基于知识图谱的医疗知识系统对于智慧医 疗的发展具有一定的辅助意义。首先，我们要建立一套完整可行的标注准 则，并依据这个准则对应电子病历中的实体关系。其次，我们要改进和提 出新的机器学习算法开发一套中文电子病历实体关系标注系统，对医疗文 本中的各类实体关系进行自动标注。目前，我们已经设计了一套实体关系 标注准则，并且已经开始测试标注工作。”
大数据研究院常务副院长崔曙光教授分管研究院的科研工作，他对研 究院旗下的几大实验室的科研进展有深入了解。他说：“我们医疗大数据 实验室瞄准基因组学这个前沿领域展开了布局，目前正与罗湖区人民医院 泌尿科开展科研合作，采用基因组学的方法精准治疗膀胱癌；金融大数据 实验室正在建设一个面向全世界科研人员的开放性金融数据平台，为科研 人员提供世界级水平的数据，促进金融大数据科研工作的开展。”
大数据研究院与深圳市卫健委、深圳市气象局和龙岗区政务服务数据管理局等政府部门签署了合作研究协议，也与中国联通网络技术研究院签署了战略合作协议，并成立了联通大数据研究院联合实验室。研究院与深 圳达实智能股份有限公司、重庆两江产业集团、无锡识凌科技公司、中国电子科技集团等许多大型企业建立了联系，苏州市大数据管理局和福建省食品药品监管局也到访大数据研究院进行深入交流，并寻求进一步合作。 研究院的合作单位还包括中电集团、南方电网、腾讯、京东、阿里巴巴、 中国移动、中信银行、深圳市博源电子商务有限公司等。
大数据研究院以关键技术基础理论研究为基础，积极进行成果转化与产业推广，促进带动我国新一代信息技术产业整体提升。
大数据研究院有这样一支队伍，专门从事医疗大数据研究。医疗大数 据实验室主任万翔博士介绍，当下医疗大数据产业正处于快速发展阶段， 团队的研究目前从三个方向有序开展：一是针对电子病例进行文本数据智 能分析，二是医学影像大数据研究，三是基因组学大数据分析。除此之 外，大数据研究院还与医院合作开发了患者数据采集管理系统。对患者智 能回访及数据采集运用了先进的物联网技术，实现大规模、全方位的患者 和医务数据采集，再通过大数据处理技术协助医生为患者提供更为精准的 诊断和治疗。比如，系统可以通过病例分析，预测患者肾结石的复发概率 及可能复发的时间；也可以基于膀胱癌患者的单细胞 RNA-Seq 数据，对 膀胱癌的亚类型进行鉴别；还可以对关键致病基因进行发掘研究。研究 院与罗湖医院就肾结石疾病复发进行的大数据统计分析预测，准确率超过 90%；与罗湖区人民医院聚焦手足口病预防措施的有效性研究，也着实为市民提供了卓有成效的医疗服务。
▲2019 年11 月6 日，罗智泉院长与深圳市卫生健康委员会的专家进行互动
目前，医疗文本标注领域尚无成熟的系统，主要有以下几个方面的原 因：一是中英文语法不同，英文系统无法应用于中文文本；二是汉语语法 表述个人性较强；三是需要大量已标签的文本数据，目前尚未有公开的此 类数据集。因此有待建立一套完整、可实用的标注准则。大数据研究院的 科研人员针对汉语语言的特点，对现有的中文医疗文本标注方法做出改 进，建立一套完整可行的词库，同时改进和提出新的机器学习算法，开发 出中文电子病历自由文本自动标注系统，对医疗文本中的各类实体及断言 ( 包括否定 ) 进行自动标注。
大数据研究院的电子病历项目计划引入中文分词技术，可以解决电子 病历数据的结构拆分难题，实现电子病历用户在实际应用中通过自然语言 进行自由文本方式输入的同时，能够通过计算机的辅助进行病历内容的数 据化，为日后的查询、统计、数据交换提供基础。还可以实现电子病历查 询的快速索引、辅助结构化输入等实用功能。
另外一个亮点工作，就是从电子病历中提取知识图谱。医学知识图谱是实现智慧医疗的基石，有望带来更高效、精准的医疗服务。然而，现有 知识图谱构建技术在医学领域中普遍存在效率低、限制多、拓展性差等问 题。团队针对医疗数据跨语种、专业性强、结构复杂等特点，对构建医学知识图谱的关键技术进行了全面解析。
万翔博士解释道：“现阶段，国内医疗领域中基于知识图谱的疾病预 测研究工作才刚起步，所以构建基于知识图谱的医疗知识系统对于智慧医 疗的发展具有一定的辅助意义。首先，我们要建立一套完整可行的标注准 则，并依据这个准则对应电子病历中的实体关系。其次，我们要改进和提 出新的机器学习算法开发一套中文电子病历实体关系标注系统，对医疗文 本中的各类实体关系进行自动标注。目前，我们已经设计了一套实体关系 标注准则，并且已经开始测试标注工作。”
大数据研究院常务副院长崔曙光教授分管研究院的科研工作，他对研 究院旗下的几大实验室的科研进展有深入了解。他说：“我们医疗大数据 实验室瞄准基因组学这个前沿领域展开了布局，目前正与罗湖区人民医院 泌尿科开展科研合作，采用基因组学的方法精准治疗膀胱癌；金融大数据 实验室正在建设一个面向全世界科研人员的开放性金融数据平台，为科研 人员提供世界级水平的数据，促进金融大数据科研工作的开展。”
大数据研究院与深圳市卫健委、深圳市气象局和龙岗区政务服务数据管理局等政府部门签署了合作研究协议，也与中国联通网络技术研究院签署了战略合作协议，并成立了联通大数据研究院联合实验室。研究院与深 圳达实智能股份有限公司、重庆两江产业集团、无锡识凌科技公司、中国电子科技集团等许多大型企业建立了联系，苏州市大数据管理局和福建省食品药品监管局也到访大数据研究院进行深入交流，并寻求进一步合作。 研究院的合作单位还包括中电集团、南方电网、腾讯、京东、阿里巴巴、 中国移动、中信银行、深圳市博源电子商务有限公司等。
大数据研究院以关键技术基础理论研究为基础，积极进行成果转化与产业推广，促进带动我国新一代信息技术产业整体提升。
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