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基于网络药理学研究延胡索中活性成分治疗冠心病的作用机制

作者：李颖，庄震坤，陈宏昱，温妙愉，蔡景太，宋晓丹，程红来源：《卫生健康发展研究》（第二期）责任编辑：yangxu1985 2023-06-27 人已围观

3.4 PPI网络

图5显示了“CR-CHD”共同靶基因的蛋白质—蛋白质相互作用。每个连接都代表一种意义，比如蛋白质的同源性、基因共表达、基因的内在相关性。基因的相邻节点越多，重要性就越高。图6是≥8个相邻节点的关键基因。

▲图5“CR-CHD”共同靶基因的PPI网络

▲图6 在PPI网络中≥8个相邻节点的关键基因

3.5“CR-CHD”共同靶基因的GO富集和KEGG通路分析

通过GO富集和KEGG通路分析，共获得70个生物学过程和67条信号通路（P＜0.05）。图7展示了P值前20的生物学过程。我们得到了P值最小的5个生物学过程，即DNA结合转录激活因子活性、富集分数最高的RNA聚合酶Ⅱ特异性、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、激酶调节因子活性、泛素样蛋白连接酶结合。通过PubMed和Embase上的文献检索，剔除了KEGG通路的广泛途径后，得到12条相关的信号通路（见表4），其中最多基因富集的信号通路是流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路（具体见图8），之后依次是TNF信号通路、细胞凋亡、MAPK信号通路和PI3K-Akt信号通路。在此基础上，再通过Cytoscape3.6.0软件构建出靶基因—分子功能和通路网络（图9），圆圈上部排列的小点表示生物学过程，通路则排列在下部，圆圈中的小点表示基因，点的大小表示节点度，点越大，基因的重要性越大。表5列出了目标基因—分子功能和通路网络中节点度≥10的基因。此外，通过MCODE插件对该网络进行分析，得到了3个重要模块，如图10所示。